2. トピックス

• 2.1. YAMLガイド
  • 2.1.1. 目次
  • 2.1.2. キーバリューペア
  • 2.1.3. コメント
  • 2.1.4. マップ
  • 2.1.5. 配列
  • 2.1.6. JSON形式
  • 2.1.7. リファレンス
• 2.2. コマンドラインツール
  • 2.2.1. ネットワークアクセス
• 2.3. Expressions
  • 2.3.1. expressionLib による外部ライブラリの利用とインラインJavaScriptコードの利用
• 2.4. Inputs
  • 2.4.1. 必須入力パラメータ
  • 2.4.2. 配列入力
  • 2.4.3. 包括的入力と排他的入力
• 2.5. 追加の引数とパラメータ
• 2.6. パラメータリファレンス
• 2.7. Outputs
  • 2.7.1. 出力ファイルの回収
  • 2.7.2. 標準出力をキャプチャする
  • 2.7.3. 出力の配列
• 2.8. カスタムタイプ
• 2.9. Expression Tool
• 2.10. ワークフロー
  • 2.10.1. ワークフローを書く
  • 2.10.2. ネストされたワークフロー
  • 2.10.3. Scatter ステップ
  • 2.10.4. 条件分岐ワークフロー
• 2.11. Operations
• 2.12. 環境変数
• 2.13. コンテナの使用
  • 2.13.1. Dockerの内部でツールを実行する
• 2.14. 実行時にファイルを作成する
• 2.15. 入力ファイルのステージング
• 2.16. ベストプラクティス
• 2.17. ファイルフォーマット
  • 2.17.1. サンプルパラメーターファイル
• 2.18. メタデータと著者
  • 2.18.1. 拡張された例
• 2.19. ソフトウェア要求事項の指定
• 2.20. トラブルシューティング
  • 2.20.1. cwltool をcachedir で実行する